目的 研究喉咽癌组织与相邻正常黏膜的基因表达谱差异，从基因组水平初步探讨喉咽癌易侵袭和转移的机制。方法 3例经病理证实为鳞状细胞癌的喉咽癌标本和邻近的正常黏膜组织标本，提取细胞总RNA，反转录为Cy3标记的癌旁正常喉黏膜cDNA，及Cy5标记的喉咽癌cDNA，与共有人类癌症相关基因886条的基因表达谱芯片Human Cancer CHIP Ver.4.0进行杂交, 杂交芯片用双通道激光扫描仪进行扫描记录,利用ImaGene分析软件将信号强度数值化。基因显著性表达的判定标准为：每个基因的喉咽癌组织和癌旁正常组织的平均灰度比值R（Cy5/Cy3）相差2倍或2倍以上，则认为差异有统计学意义。结果 在3例样本中重复表达且相差2倍以上的基因共51个,喉咽癌组织表达上调者39个,表达下调者12个。本实验发现显著差异的新基因4个,这些基因序列已被测出,但其功能却未知。其中表达差异非常显著（平均相差5倍以上）的主要包括，上调基因：基质金属蛋白酶-1 （MMP-1），整合素β4（Integrinβ4），Bcl-2，CXCL13，黑色素瘤特异性抗原(PRAME )；下调基因：早期生长反应基因-1 (early growth respons gene-1, Egr-1)，MRP1/ CD9。结论 基因芯片技术可以用来筛选在喉咽癌肿瘤细胞增殖、侵袭、转移过程中发挥重要作用的多种基因，为进一步深入研究提供靶点。
